НСИ проводятся по всей стране для того, чтобы оценить, каких успехов достигли ученики. Проверяют их знания по предметам, умение мыслить и применять эти знания на практике. Кроме того, оценивают воспитательную работу школы.15 октября — оценка воспитательной работы (9-е классы всех школ республики).
Продолжительность каждого исследования — два урока не более 45 минут каждый. Расписание проведения исследования школа определяет самостоятельно.
Результаты НСИ используют на федеральном уровне для анализа и оценки состояния и перспектив развития системы образования России. Для каждой школы формируется индивидуальный профиль по воспитательной работе, где отражаются сведения о том, насколько в школе безопасно в психологическом плане, чувствуют ли дети себя счастливыми, какие у них жизненные ценности, и насколько хорошо педагоги справляются со своей работой.